«جایزه علیمحمدی» در سال 1394 به صورت مشترک به آقایان حبیب رستمی فارغ‌التحصیل پژوهشگاه دانش‌های بنیادی و مجتبی گلشنی قریه‌ علی فارغ‌التحصیل دانشگاه صنعتی شریف اهدا شد.
 پژوهشگاه دانش‌های بنیادی و انجمن فیزیک ایران از سال ۱۳۹۰ «جایز‌ه علیمحمدی» را پایه گزاری کردند و این جایزه را به بهترین  رساله‌ی دکترای فیزیک، که در داخل کشور انجام شده باشد اعطا می‌کنند. ارزش مادی این جایزه ۱۰ میلیون تومان است.
این جایزه به پاس خدمات علمی و دانشگاهی شهید دکتر مسعود علیمحمدی، استاد فقید دانشگاه تهران و اولین دانش‌آموختۀ دکترای فیزیکِ داخل کشور که نقش مؤثری در زیرساخت علمی پژوهشگاه دانش‌های بنیادی داشته است و همچنین به پاس تلاش‌های وی برای برپایی تحصیلات تکمیلی در ایران، به نام ایشان نامگذاری شده است.
مراسم اعطای جایزه روز چهارشنبه 30 اردیبهشت ماه 1394 در پژوهشگاه دانش‌های بنیادی در حضور مسئولان پژوهشکده و نمایندگان انجمن فیزیک ایران برگزار شد.